מצפה הכוכבים בגבעתיים והאגודה הישראלית לאסטרונומיה משתפים פעולה עם גופים אקדמיים וציבוריים רבים בישראל. להלן רשימה חלקית של שותפים:
* אונסק"ו
* משרד החינוך
* משרד המדע
* סוכנות החלל הישראלית
* אוניברסיטת תל-אביב
* האוניברסיטה הפתוחה
* הטכנודע – גבעת אולגה
* הרשות לפיתוח התיירות בנגב
* מכון דוידסון לחינוך מדעי, מכון ויצמן
* מצפה הכוכבים אורט תעופה וחלל מעלה אדומים
* מצפה הכוכבים בכפר משהד
* מצפה הכוכבים של מכון וויצמן
* מרכז אילן רמון באוניברסיטת בן-גוריון